"底物被纳入MRD测定的潜力是具体的,希望这些实质性将独自减少不够有利于MRD测定的性能指标。"
结核病的MRD测定是一种敏捷且特异的主要用途受控结核病症状体内中都源性遗传物质(如ctDNA)相对量的原理。在这种状态下,症状未肉眼可见的鳞状,但确实共存标准流行病学影像原理难以测定到但再度时会加剧结核病发作的均匀分布鳞状。
MRD,常以称为均匀分布存留鳞状(Minimal Residual Disease)。运主要用途“Minimal” (均匀分布)这个用语,是因为它在手抄本和流行病学研究者中都不够常以用。不过,“Minimal”这个用语有可能很强“误导性”,因为长期的病变在HRS和疗法议程方面也有可能很强重要意义。“Measurable”(可量度)一用语可不够确切地描述存留在患者体内的细胞的共存。NCCN范本同时运主要用途了“Minimal Residual Disease”(均匀分布存留鳞状)和“Measurable Residual Disease”(可量度存留鳞状)两个术语。
此外,可行性研究工作表明在底物素质上测定多种结核病类型的ctDNA都只很强流行病学效用,手抄本和流行病学研究者有时也时会运主要用途“Molecular Residual Disease”(底物存留鳞状)一用语。
近期,国内外在并不一定中都基于ctDNA的MRD评量(ctDNA-MRD)的流行病学统计数据和迹象越来越多,开启了并不一定疣MRD测定的热潮。并不一定疣ctDNA-MRD测定的新科技表现形式主要有两大类:
1)Tumor-informed assays(坚称分析原理)
对原发民间两组织来进行较低通量以鉴别症状的免疫状两组相异研究成果,然后外观设计程序会定制panel或运主要用途互换panel来进行个人化的ctDNA测定分析原理。
2)Tumor-uninformed assays(不坚称分析原理)
也可以称为Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays,即不须原发民间两组织,大部分比如说三两组先行选定程序会/探针外观设计的与结核病类型涉及的互换panel来进行ctDNA测定分析原理,常以在测定ctDNA基因突变的同时,先以ctDNA底物或视频两组讲授等多两组讲授原理。弥补了民间两组织样本缺乏或受控位点缺乏或TAT过长等疑虑。
Tumor-informed assays的新科技意图不够不符大众的认知,在保证较低免疫的有假定下,可通过受控多位点的sample-level(样本素质)有利于减少其敏感度,新科技门槛相对来说不是特别较低。Tumor-uninformed assays的新科技意图不够近似于早捻,通过减少site-level(位点素质)测定敏感度并先以ctDNA底物或视频两组讲授并拢合机器讲授习方法有利于减少其敏感度和免疫,新科技门槛相对来说较较低。
2021年4月29日,《Clinical Cancer Research》在线发表了“大部分运主要用途胆红素ctDNA测定拢肺结核病状均匀分布存留鳞状(MRD)”的文章,首次官方网站了Guardant Reveal的研究工作统计数据:MRD测定敏感度超越91%,免疫远超100%,这些见到支持了大部分胆红素ctDNA-MRD测定(Tumor-uninformed assays)的潜在流行病学应主要用途。
2021年8月13日,《Clinical Cancer Research》在线发表了“顺应潮流:大部分胆红素ctDNA-MRD测定的应主要用途同一时间景”的文章,在这底下研究工作者们讨论评量了大部分胆红素ctDNA测定MRD的能力,以及将底物紧密转化到ctDNA测定的潜在诱因。2
Parikh及其同事1 和Taieb及其同事3 讨论了大部分胆红素ctDNA-MRD测定在拢肺癌(CRC)症状中都的潜在流行病学应主要用途。
▲ ctDNA底物和基因突变在两项研究工作中都的应主要用途相比较(Parikh和Taieb)
拢肺癌(CRC)的疗法仍然面对着一个挑战,即都有的CRC症状因早期疾病发作而过早生还。尽管流行病学改用了标准的常规疗法,但较低风险IIIC期CRC症状的5年成功率也大部分有53%,毕竟是未见到影像讲授上并未测定到的均匀分布存留鳞状(MRD)。4
在此之同一时间,仍有鉴于确切确定哪些症状术后共存MRD,以试图督导减少或增加常规疗法,并增加自愈的有有可能,同时最大限度地减少不必要疗法的涉及毒性。
在过去的几年底下,我们对ctDNA在CRC诊断和HRS中都的应主要用途有了普遍的了解。在此之同一时间,基于ctDNA的MRD评量恰巧普遍应主要用途于结核病的疗法中都。
ctDNA是由DNA的短视频两组合成(大约130-150bp),由细胞通过凋亡、病变或分泌释放到消化道中都。 ctDNA的砹较短致使其成敏感的实时负重研究课题,它的共存有可能解读了影像讲授上看不见的凝转移。
在自愈性疗法拢束后,ctDNA中都出现的线粒体基因突变对随后的影像讲授发作很强较较低的白血病得出价值,特别是当这些基因突变与手术的民间两组织中都的基因突变相匹配时。测定这种ctDNA判别的MRD可以在I-III期CRC中都天内影像讲授数月得出发作,从而为三两组再度时会发作的CRC症状透过一个评量新的疗法的窗口。然而,这些ctDNA制度化基因突变判别的MRD测定原理的敏感度仍然是有限的,有鉴于改进其测定性能指标。
ctDNA的底物测定相对于ctDNA的制度化基因突变测定。ctDNA的底物精神状态以在CRC中都十分以常以见,并被视为大多数癌变的早期期中。这种底物,具体判别为DNA中都胞嘧啶的C5所在位置添加烷基基团,通气周围性状的表远超,包含经典的惟恐癌性状失活。与制度化基因突变远比,CRC中都共存不够多的底物精神状态以区域,为减少MRD测定的敏感度透过了机时会。SEPT9,就是第一个利用体内测定单性状底物精神状态以来进行捻查和早期测定CRC的原理。尽管ctDNA底物有这些实用性,但这些有所不同的特性也所只需果断,以保证测定分析原理的免疫,并可不必要有假白血病的有有可能。
在这种背景下,Parikh和Taieb的除此以外简介的研究工作拢果为我们对ctDNA性能指标的解释透过了有用的足量,即不须原发民间两组织,大部分通过体内ctDNA底物或联合ctDNA基因突变即可来进行确切的MRD评量。与其他所只需对原发民间两组织来进行较低通量以督导后续ctDNA分析原理的测定不同,除此以外研究工作深入探讨了Tumor-uninformed assays的实证,它有几个竞争者,包含快速的TAT,降低初始运输成本,对民间两组织缺乏或不宜用的症状来进行受控。
Parikh等人透过了一种ctDNA底物拢合ctDNA制度化基因突变的互换panel来进行MRD的分析原理评量(NGS原理),与其他零售上能用的MRD测定原理远比,这种原理不所只需手术的民间两组织以及定制化。在再度疗法后运主要用途时,这种大部分胆红素ctDNA-MRD测定对发作很强流行病学意义的免疫(100%)和敏感度(55.6%),通过紧密转化各部位性状两组特征和垂直受控分析原理,其敏感度可有利于减少至91%。1 该原理被主要用途恰巧在来进行的同一时间瞻性研究工作,包含督导IIA期拢肠癌疗法议程的NRG合作开发两组研究工作(NCT04068103)。虽然还所只需额外的统计数据集来解析这些见到,但这些拢果确实了基于ctDNA的MRD测定在不坚称的只能可接受的测定性能指标特征。
Taieb等人的研究工作利用了一对先同一时间被确实是CRC手术后HRS涉及的底物性状标示出物WIF1和NPY(ddPCR原理),并将它们应主要用途于PRODIGE-GERCOR IDEA-France次测试,将III期CRC症状随机分成3个月 vs 6个月的常规复发。在对举办III期次测试的III期CRC症状来进行的首次ctDNA-MRD评量中都,有13.8%的症状术后为ctDNA-MRD白血病,并被确认为独立的HRS研究课题。3 同时,研究工作者也认为,与其他改用NGS原理的ctDNA-MRD研究工作远比,本研究工作中都ctDNA的白血病率较差。敏感度和PPV都只低于NGS测定拢果,ctDNA-MRD白血病和比如说的5年DFS分别为65%和73%,尽管常规疗法的和不难得的同一时间分析原理样本处理有有可能对这些拢果产生负面影响。该原理值得注意的是其相对单纯,十分以低的运输成本和潜在的重现性,不所只需零售测定中都所见的专利权测定原理。恰巧在来进行的同一时间瞻性研究工作将有利于评量大部分胆红素ctDNA测定应该必需确切评量MRD,以便对CRC症状来进行风险低层,并督导常规疗法议程。
无论改用何种原理,大部分用胆红素ctDNA-MRD测定来督导CRC症状的疗法要求,所只需可靠且确切的测定原理。只需有利于减少大部分胆红素ctDNA-MRD测定的敏感度来确定哪些症状可以从疗法降级中都获益,以不必要不恰当地选择较低危症状接受较差强度的疗法。Parikh及其同事的研究工作拢果表明,紧密转化性状两组和各部位性状两组以及垂直胆红素受控,可显着减少大部分胆红素ctDNA-MRD的敏感度。远比之下,ctDNA-MRD测定的较低免疫对于ctDNA作为一个值得注意的人类研究课题来确定疗法新增是至关重要的。由于免疫缺乏,有假白血病的ctDNA-MRD有有可能使症状接受不必要的强复发法。Parikh及其同事的研究工作拢果确实,除制度化基因突变外,还可以通过拢合各部位性状两组底物特征的分析原理来保证免疫。Taieb等人的分析原理原理的竞争者在于减少了流行病学特征的敏感度和HRS,但是,恰巧如研究工作者承认的那样,另行的两个性状底物标示出有可能难以透过与拢合制度化基因突变原理的性能指标特征。重要的是,这项工作也合理化了基本分析原理同一时间条件的重要性,因为各种提取原理可以在很小程度上负面影响ctDNA的得率和值得注意性。在并下一代的研究工作中都,这些分析原理同一时间的再考虑将显得越来越重要。
底物被纳入MRD测定的潜力是具体的,希望这些实质性将独自减少不够有利于MRD测定的性能指标。总之,大部分胆红素ctDNA-MRD的测定透过了一个独有的机时会,运主要用途一种无创原理来探索疗法解决方案,并也许根除较低危症状的凝转移性鳞状。这些研究工作拢果毫无疑问为并下一代ctDNA-MRD督导的同一时间瞻性流行病学次测试铺平了较低架桥。
MRD,仍然是一个快速发展的领域,我们预计近两年有有可能出现新的的迹象,要么辨识出MRD测定的流行病学效用的或许,要么辨识出MRD测定的其他竞争者和新的可作。
参考资料:
1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.
2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.
3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.
4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.
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